At1g53160.1

At1g53160.1 68408.m05523 transcription factor -related

Matching miRNAs:
miRNA nameIGR namemature miRNA sequenceTargetsRfam
1prec18827igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544TGACAGAAGAGAGTGAGCACACA7ath-MIR156d
2prec18857igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC13ath-MIR156d
3prec18871igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2545TTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC11ath-MIR156d
4prec18881igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2546GTTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC12ath-MIR156d
5prec19162igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC13ath-MIR156e
6prec19178igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3581TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC13ath-MIR156e
7prec19210igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586TGACAGAAGAGAGTGAGCACACA7ath-MIR156e
8prec3205igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4188+4281GGTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC10ath-MIR156f
9prec3217igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC13ath-MIR156f
10prec3249igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279TGACAGAAGAGAGTGAGCACACA7ath-MIR156f
11prec3773igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3561-3644CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA10ath-MIR156a
12prec3817igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3562-3643TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC13ath-MIR156a
13prec8264igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_56+137CTGACAGAAGAGAGTGAGCACA13ath-MIR156b
14prec8284igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_57+136TGACAGAAGAGAGTGAGCACA13ath-MIR156b
15prec8512igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3138-3222CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA10ath-MIR156c
16prec8580igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3139-3221TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC13ath-MIR156c

Gene Sequence:

uugcuuaacc uauuagaguu uccuuccucc aacaaaccau cuuuauaaga cuccaaaAUG     60 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

GAGGGUAAGA GAUCACAAGG ACAAGGUUAC AUGAAAAAGA AGUCUUACCU UGUGGAAGAA    120 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

GAUAUGGAGA CUGAUACGGA UGAAGAAGAG GAAGUAGGUA GGGAUAGAGU UAGAGGGUCU    180 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

AGAGGUAGCA UCAAUCGUGG UGGCUCGUUG CGGCUUUGCC AAGUAGAUAG AUGCACAGCU    240 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

GAUAUGAAAG AGGCAAAACU GUAUCACCGG AGACACAAAG UGUGUGAAGU UCAUGCAAAG    300 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

GCAUCUUCUG UCUUUCUCUC AGGACUUAAC CAACGCUUUU GUCAACAAUG CAGUAGGUUU    360 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

CAUGACCUCC AAGAGUUUGA UGAAGCUAAG AGAAGUUGCA GGAGGCGCUU AGCUGGACAC    420 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

AAUGAGCGAA GAAGGAAGAG CUCUGGUGAG AGUACUUAUG GAGAAGGAUC AGGUCGGAGA    480 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

GGAAUCAAUG GUCAGGUGGU GAUGCAGAAU CAAGAAAGAU CAAGGGUAGA GAUGACACUU    540 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

CCUAUGCCAA ACUCAUCAUU CAAGCGACCA CAGAUUAGAU AGagaagcug ucugcucucu    600 
.......... .......... .......... .......... ........** **********        prec18827
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec18857
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec18871
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec18881
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec19162
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec19178
.......... .......... .......... .......... ........** **********        prec19210
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec3205
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec3217
.......... .......... .......... .......... ........** **********        prec3249
.......... .......... .......... .......... ........** **********        prec3773
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... **********        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... **********        prec8284
.......... .......... .......... .......... ........** **********        prec8512
.......... .......... .......... .......... .........* **********        prec8580

cucuucuguc aucuaaacuu cucucuuaga auccuaaaau ugugguaucu aacaauguua    660 
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
********** **........ .......... .......... .......... ..........        prec18871
********** ***....... .......... .......... .......... ..........        prec18881
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
********** ***....... .......... .......... .......... ..........        prec3205
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
********** **........ .......... .......... .......... ..........        prec3773
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
********** **........ .......... .......... .......... ..........        prec8264
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
********** **........ .......... .......... .......... ..........        prec8512
********** *......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

uagagaaaua aauaacuacc acucucucua guacucucua auguuaucag cuauaugcaa    720 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

acgcuaagac uauacuugaa ccuugagugu uaucuuguau guuucaaaga uauggcuaau    780 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18827
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18857
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18871
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec18881
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19162
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19178
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec19210
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3205
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3217
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3249
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3773
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec3817
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8264
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8284
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8512
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec8580

gauaugugua auacuucuac cu   802 
.......... .......... ..       prec18827
.......... .......... ..       prec18857
.......... .......... ..       prec18871
.......... .......... ..       prec18881
.......... .......... ..       prec19162
.......... .......... ..       prec19178
.......... .......... ..       prec19210
.......... .......... ..       prec3205
.......... .......... ..       prec3217
.......... .......... ..       prec3249
.......... .......... ..       prec3773
.......... .......... ..       prec3817
.......... .......... ..       prec8264
.......... .......... ..       prec8284
.......... .......... ..       prec8512
.......... .......... ..       prec8580