At4g00150.1 68411.m00015 scarecrow-like transcription factor 6 (SCL6)
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec14310 | igr4069#chr3#x1=19080185#l=1539_1255+1346 | TCTGATTGAGCCGCGCCAATATC | 3 | ath-MIR171 |
| 2 | prec14318 | igr4069#chr3#x1=19080185#l=1539_1255+1348 | GATTGAGCCGCGCCAATATCTC | 3 | ath-MIR171 |
| 3 | prec15835 | igr4835#chr1#x1=22526634#l=6090_3256-3338 | TGATTGAGCCGTGCCAATATCAC | 3 | |
| 4 | prec15845 | igr4835#chr1#x1=22526634#l=6090_3258-3336 | TGATTGAGCCGTGCCAATATC | 3 | |
| 5 | prec19459 | igr961#chr1#x1=3960414#l=2862_954-1039 | GATTGAGCCGTGCCAATATCACG | 3 | |
| 6 | prec19467 | igr961#chr1#x1=3960414#l=2862_955-1038 | GATTGAGCCGTGCCAATATCAC | 3 | |
| 7 | prec19471 | igr961#chr1#x1=3960414#l=2862_957-1036 | GATTGAGCCGTGCCAATATC | 3 |
Gene Sequence:
aggaggaagc ccacuuugcc acuuuaauau cuugcacgca uccaauauac cucaccacac 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14310 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14318 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15835 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15845 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19459 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19467 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19471 cacaucacaa caacgaagaa gaagaagaag aagaagagcu ucaagaagac aaauacacua 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14310 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14318 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15835 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15845 .......... .......... 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auuuuugauc 2040 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14310 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14318 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15835 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15845 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19459 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19467 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19471 gac 2043 ... prec14310 ... prec14318 ... prec15835 ... prec15845 ... prec19459 ... prec19467 ... prec19471