At2g45160.1 68409.m05078 scarecrow transcription factor family
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec14310 | igr4069#chr3#x1=19080185#l=1539_1255+1346 | TCTGATTGAGCCGCGCCAATATC | 3 | ath-MIR171 |
| 2 | prec14318 | igr4069#chr3#x1=19080185#l=1539_1255+1348 | GATTGAGCCGCGCCAATATCTC | 3 | ath-MIR171 |
| 3 | prec15835 | igr4835#chr1#x1=22526634#l=6090_3256-3338 | TGATTGAGCCGTGCCAATATCAC | 3 | |
| 4 | prec15845 | igr4835#chr1#x1=22526634#l=6090_3258-3336 | TGATTGAGCCGTGCCAATATC | 3 | |
| 5 | prec19459 | igr961#chr1#x1=3960414#l=2862_954-1039 | GATTGAGCCGTGCCAATATCACG | 3 | |
| 6 | prec19467 | igr961#chr1#x1=3960414#l=2862_955-1038 | GATTGAGCCGTGCCAATATCAC | 3 | |
| 7 | prec19471 | igr961#chr1#x1=3960414#l=2862_957-1036 | GATTGAGCCGTGCCAATATC | 3 |
Gene Sequence:
cucucuucuu uuguugucuu ucuguucugu ucuugagauc ucucucucuc ucucucucua 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14310 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14318 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15835 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15845 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19459 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19467 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19471 ggguuauuuu uuucuggguu uuuuguuuuu acaguuacuc uguguuguug aggaggcgAU 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14310 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14318 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15835 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15845 .......... .......... 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GGAAAUGUUA 2040 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14310 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14318 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15835 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15845 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19459 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19467 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19471 Gacgaagaag aaaccacaaa ucucucucuc gcuuagcuaa uuucucuguu uuucuuuguc 2100 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14310 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec14318 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15835 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec15845 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19459 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......... prec14318 ......... prec15835 ......... prec15845 ......... prec19459 ......... prec19467 ......... prec19471