At1g77850.1

At1g77850.1 68408.m08325 transcriptional factor B3 family

Matching miRNAs:
miRNA nameIGR namemature miRNA sequenceTargetsRfam
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Gene Sequence:

aagacaucac ggucucucuc uauaaaaaca guaccuaccu cuucuucuuc uucuucauuc     60 
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gcugacuucg uuuacacuga aaacaaauac cuAUGUCACC GCCGUCGGCA ACCGCCGGUG    120 
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ACAUCAACCA CCGUGAAGUA GACCCGACGA UCUGGCGCGC UUGUGCUGGA GCCUCCGUCC    180 
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AGAUCCCUGU CCUUCACUCU AGGGUUUACU ACUUUCCACA AGGUCACGUU GAGCACUGUU    240 
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GCCCUCUCCU CUCUACUCUU CCUUCCUCCA CCUCGCCGGU UCCAUGUAUC AUCACUUCAA    300 
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UUCAGUUGCU CGCCGAUCCG GUCACCGACG AGGUCUUUGC UCACCUUAUU CUUCAACCGA    360 
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UGACGCAGCA GCAGUUUACU CCGACUAAUU AUUCACGAUU CGGCAGAUUC GAUGGCGAUG    420 
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UUGAUGAUAA CAACAAGGUG ACUACCUUCG CCAAAAUUCU CACGCCUUCU GAUGCUAACA    480 
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AUGGAGGUGG CUUCUCCGUU CCUCGUUUCU GUGCUGAUUC CGUCUUCCCU CUGCUUAAUU    540 
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UUCAAAUCGA UCCACCGGUU CAGAAGCUCU ACGUCACUGA UAUCCAUGGA GCUGUUUGGG    600 
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AUUUCAGGCA UAUCUAUCGC GGUACACCGA GGCGUCACUU GCUAACAACG GGAUGGAGUA    660 
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AGUUCGUCAA UAGCAAGAAG CUCAUCGCUG GAGAUUCGGU GGUGUUUAUG AGAAAAUCUG    720 
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CAGAUGAGAU GUUCAUCGGC GUUAGGAGAA CUCCGAUCUC AAGCAGCGAC GGAGGAAGUA    780 
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GCUAUUACGG AGGAGAUGAG UAUAACGGUU ACUACAGUCA GAGUAGCGUU GCCAAGGAAG    840 
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AUGAUGGGAG UCCGAAGAAG ACGUUUAGGA GAUCUGGGAA UGGUAAGUUG ACUGCUGAGG    900 
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CUGUGACGGA UGCGAUCAAU AGAGCGUCUC AGGGAUUACC AUUUGAGGUG GUGUUUUAUC    960 
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CGGCUGCUGG AUGGUCUGAG UUUGUUGUGA GAGCUGAAGA UGUUGAGUCU UCAAUGUCUA   1020 
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UGUAUUGGAC UCCUGGGACU CGAGUCAAGA UGGCUAUGGA GACUGAAGAU UCUUCUCGGA   1080 
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UCACAUGGUU UCAAGGCAUC GUUUCCUCUA CUUAUCAGGA GACCGGUCCA UGGCGUGGAU   1140 
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CUCCAUGGAA GCAGCUUCAG AUCACAUGGG AUGAACCUGA GAUUCUGCAA AACGUGAAGA   1200 
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GGGUGAAUCC AUGGCAAGUG GAAAUUGCUG CACAUGCAAC UCAACUGCAU ACCCCUUUCC   1260 
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CUCCAGCAAA GAGGUUGAAG UAUCCACAAC CCGGAGGAGG GUUCUUGAGU GGAGAUGAUG   1320 
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GAGAAAUCCU UUAUCCUCAA AGUGGACUGU CUAGUGCAGC AGCACCUGAU CCAAGUCCUU   1380 
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CUAUGUUCUC GUAUUCUACA UUUCCUGCUG GCAUGCAGGG AGCCAGGCAA UAUGAUUUUG   1440 
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.......... .......... .........* ********** *********. ..........        prec2086
.......... .......... .......*** ********** *********. ..........        prec2098

GGUCUUUCAA UCCAACCGGA UUCAUUGGAG GAAAUCCUCC CCAGCUAUUC ACCAAUAACU   1500 
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UCUUAAGUCC GCUUCCUGAU UUGGGAAAAG UGUCGACUGA GAUGAUGAAC UUUGGCAGUC   1560 
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CGCCAUCAGA UAACUUAUCG CCUAAUAGCA ACACCACUAA UCUGUCCUCU GGAAAUGACC   1620 
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UGGUUGGAAA CCGAGGCCCC CUUUCAAAGA AAGUUAACUC GAUUCAGUUG UUUGGCAAGA   1680 
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UCAUUACCGU GGAGGAGCAU UCUGAGAGCG GUCCUGCAGA GUCUGGCUUG UGUGAAGAGG   1740 
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AUGGCAGCAA AGAGUCCAGC GACAAUGAGA CACAGUUGUC CUUAUCACAU GCUCCUCCAA   1800 
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GCGUGCCUAA ACAUUCCAAC AGCAACGCAG GUUCUAGCUC CCAAGGUUAA aaagugaaag   1860 
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aaguggugga ucuuugcugg aaucuccaag uccuaaguag uaguaguagu acuauuauau   1920 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec11519
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auaauucugu uguuucugca auugacuuuu cucuggcuuu ucuuugccac gugacgauuc   1980 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec11519
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2062
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2070
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2078
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2086
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2098

cguuuuuuac uuucuuucuu uuuuuuuuau caauuucuca gacacauuug augaacaucu   2040 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec11497
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec11509
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec11519
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2062
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2078
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2086
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec2098

cgcucucauc uaaucguuaa cuauuuuuau uggggu  2076 
.......... .......... .......... ......       prec11497
.......... .......... .......... ......       prec11509
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