At1g69170.1 68408.m07265 squamosa-promoter binding protein -related
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec18857 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156d |
| 2 | prec18881 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2546 | GTTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 12 | ath-MIR156d |
| 3 | prec19162 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 4 | prec19178 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3581 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 5 | prec3205 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4188+4281 | GGTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 10 | ath-MIR156f |
| 6 | prec3217 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156f |
| 7 | prec3773 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3561-3644 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 10 | ath-MIR156a |
| 8 | prec3817 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3562-3643 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156a |
| 9 | prec8264 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_56+137 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 10 | prec8284 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_57+136 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 11 | prec8512 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3138-3222 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 10 | ath-MIR156c |
| 12 | prec8580 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3139-3221 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156c |
Gene Sequence:
ugcuuccuau acacaguucu ucucuguucc ucuaaucggg uuugaaucuu uucgucaauu 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 ucuaucuggg uuuuguguua aucgaaggaa uaagugaauc gucgucuugg guuuucucua 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 uuuagaagaa agcuuccucc uuuaggguuu cugcaucagu uauugaauug cuaguugucg 180 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 uugaagaaag cagaaauuga uuauaguguu gcugAUGGAU UCUUGGAGCU ACGGGAGAAG 240 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CGUUUUCAUG UCAAAUGAAA CUCUUUUACC UUGUGAUACU UUUGCUAAGA AUAGAAGAUU 300 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 UGAACAGAGA CUCUCUAAUA AUGAUGAUGU GUUGAUUUCU GACAUGGCUG GUAACUCCAA 360 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 UGGAUUCAGU GCUGUUUCUA UUACUAAAGU UGUUCCUGAA GAGGAAGAUG AGGAGAACAU 420 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 AUCUUCUUCU UCAAAGUUCU CUAGUCAGGA AUUGAAUAGG AUAGAUUUCA AACUUAGGAG 480 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CUUUUUGGAU UUAGGAAAUG AUGAUGAUGA UACAUCCUCU AGAGGUUUUG CUCUGCCAUC 540 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 UAAAAAGUCU CGAGCUUCAA ACUUGUGCUC UCAGAAUCCC UUGUGUCAAG UUUAUGGGUG 600 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 UAGUAAGGAU CUGAGCUCUU CGAAAGAUUA CCACAAAAGG CAUAGAGUUU GCGAGGCUCA 660 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 UUCGAAAACU UCUGUGGUCA UAGUUAAUGG UCUUGAACAG AGGUUUUGUC AACAGUGCAG 720 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CAGGUUUCAU UUCCUCUCAG AGUUUGAUGA UGGCAAAAGA AGUUGCAGAA GGCGAUUAGC 780 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CGGUCACAAU GAACGAAGAA GGAAACCUGC AUUCUAUUUC CUACCGGGUA AGCGCCAUAA 840 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 GCUUCUUCGC ACCUCUCAAG AUGUAGUAGG CAACAAGUUU CUGGAGAAUU CAUCAUUGGU 900 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 AUUGCCAGAG UCAUUUCCUG GUAGUCUCUU AUACAGAGUA AUAGAUGAAG ACGACCACCG 960 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 UACAAGUAGA CUCGUGAGUU UCAAAGAUGA ACCUACUUGU UCCAUGUUUC CUACUAAUGA 1020 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 GCAAAACAGC AGCAGAACUU AUGAAUCUAA ACCAGCAAUU UAUUCCACGG AAGUAUCCUC 1080 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CAUUUGGGAC UUACAUGAGA CGGCGGCAUC ACGCUCUACU CGUGCUCUCU CUCUUCUGUC 1140 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec18857 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec18881 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec19162 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec19178 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec3205 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec3217 .......... .......... .......... ........** ********** ********** prec3773 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec3817 .......... .......... .......... .......... ********** ********** prec8264 .......... .......... .......... .......... ********** ********** prec8284 .......... .......... .......... ........** ********** ********** prec8512 .......... .......... .......... .........* ********** ********** prec8580 AGCUCAGUCC CAACAACACU UGUCUAAGUU UCCAAACACA ACGUUCUCAA UCACCCAACC 1200 *......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 ***....... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 *......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 *......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 ***....... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 *......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 **........ .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 *......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 **........ .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 *......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 **........ .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 *......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CAACCAAAAU CUCAAUCACU CAUCAUCAAC UGACUAUCAU CAGAUGGAAC AACCGUUGUG 1260 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 GAUCGAUCCU GGCAAGACCA AUUCUGCUGG UUCUAGUUCU UGUAAAGGAA AAGGAACAUC 1320 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CACGGUUGAU CUACUGCAAC UGUCAUCACA UCUUCAAAGA AUCGAGCAAC AGAGGAAUUA 1380 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CACUGGUGAU GUGAAGCAGG AAUAUAAUGA GCUUUAUUUC CCUGGCUCCU AAuaaaaggu 1440 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 uacaacauuc uuauuccuuu aaaccgguuc gaguuucuug agauuguucu gcagaaggac 1500 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 aagacaagcc ugcauggcuu gauuaguuug ugauuagaua gaggaauuaa gaggaucaga 1560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 ucauguuaca cguauuauug uaauuuguaa cuguuguguu auuauucacc agucaauaau 1620 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 guucugaaga aaauugcuuc agauaucuau gccu 1654 .......... .......... .......... .... prec18857 .......... .......... .......... .... prec18881 .......... .......... .......... .... prec19162 .......... .......... .......... .... prec19178 .......... .......... .......... .... prec3205 .......... .......... .......... .... prec3217 .......... .......... .......... .... prec3773 .......... .......... .......... .... prec3817 .......... .......... .......... .... prec8264 .......... .......... .......... .... prec8284 .......... .......... .......... .... prec8512 .......... .......... .......... .... prec8580