At1g27360.1 68408.m03023 squamosa-promoter binding protein 2 -related
Matching miRNAs:
miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
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1 | prec18857 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156d |
2 | prec18871 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2545 | TTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 11 | ath-MIR156d |
3 | prec18881 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2546 | GTTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 12 | ath-MIR156d |
4 | prec19162 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
5 | prec19178 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3581 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
6 | prec3205 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4188+4281 | GGTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 10 | ath-MIR156f |
7 | prec3217 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156f |
8 | prec3817 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3562-3643 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156a |
9 | prec8264 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_56+137 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
10 | prec8284 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_57+136 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
11 | prec8580 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3139-3221 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156c |
Gene Sequence:
aagguaucua uuugccuagc cagaguuaua uauaggauug auugucuagu cuuuucuuau 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 augauuuuug uucucauuua cuaaucaaag uucugcaaac uuguaguugu uguaggauuu 120 .......... .......... 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