At5g43270.2 68412.m07893 squamosa promoter binding protein-related 2 (emb|CAB56576.1)
Matching miRNAs:
miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
---|---|---|---|---|---|
1 | prec18857 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156d |
2 | prec18871 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2545 | TTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 11 | ath-MIR156d |
3 | prec18881 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2546 | GTTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 12 | ath-MIR156d |
4 | prec19162 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
5 | prec19178 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3581 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
6 | prec3217 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156f |
7 | prec3817 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3562-3643 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156a |
8 | prec8264 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_56+137 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
9 | prec8284 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_57+136 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
10 | prec8580 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3139-3221 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156c |
Gene Sequence:
acucguaaac uuaaaaaaaa aaaaaaaaaa acagaacaau uucuucuucc ucugggaucc 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 auaaguuuug agauuuuggu ggucaguguc ugAUGGAGUG UAAUGCAAAG CCACCGUUUC 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 AAUGGGAAUU GGAAAACUUG AUAUCUUUUG GCACUUCUAC AGCUGAAGUU CCUAGAAAGC 180 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... 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GGAUUGAUAC UUCUCCAAGU CUUGAACUUU 420 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CUUUUGGCUC UGGUGAUCCG GUUCUCGGUU UAAAGCUUGG UAAACGAACG UACUUUGAAG 480 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 guguacuacg aaauugau 1578 .......... ........ prec18857 .......... ........ prec18871 .......... ........ prec18881 .......... ........ prec19162 .......... ........ prec19178 .......... ........ prec3217 .......... ........ prec3817 .......... ........ prec8264 .......... ........ prec8284 .......... ........ prec8580