At5g43270.1 68412.m07892 squamosa promoter binding protein-related 2 (emb|CAB56576.1)
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec18857 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156d |
| 2 | prec18871 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2545 | TTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 11 | ath-MIR156d |
| 3 | prec18881 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2546 | GTTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 12 | ath-MIR156d |
| 4 | prec19162 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 5 | prec19178 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3581 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 6 | prec3217 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156f |
| 7 | prec3817 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3562-3643 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156a |
| 8 | prec8264 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_56+137 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 9 | prec8284 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_57+136 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 10 | prec8580 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3139-3221 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156c |
Gene Sequence:
acucguaaac uuaaaaaaaa aaaaaaaaaa acagaacaau uucuucuucc ucugggaucc 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 auaaguuuug agguauguug uugcugauuu uguccuuuua ugucugcaaa uaacagagaa 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... 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CCAUUAGCUC UUCAUCAGCU GAAGUAAGAA 420 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CACACAAUUU UACAUCCGAA ACUGGUGAAA GUCUUCCUGG AGAAUUUGCA AAGGGGAUUG 480 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... 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