At2g33770.1 68409.m03744 ubiquitin-conjugating enzyme family
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec16355 | igr5124#chr5#x1=24569732#l=3135_933+1024 | TGCCAAAGGAGAGTTGCCCT | 4 | |
| 2 | prec5821 | igr2413#chr1#x1=10226044#l=3960_1028+1126 | TATCTGCCAAAGGAGATTTGCCC | 1 | |
| 3 | prec5827 | igr2413#chr1#x1=10226044#l=3960_1028+1126 | TCTGCCAAAGGAGATTTGCCC | 2 | |
| 4 | prec5831 | igr2413#chr1#x1=10226044#l=3960_1028+1126 | CTGCCAAAGGAGATTTGCCC | 5 | |
| 5 | prec9530 | igr2959#chr2#x1=14390339#l=3764_1645+1727 | TCTGCCAAAGGAGATTTGCC | 2 | |
| 6 | prec9542 | igr2959#chr2#x1=14390339#l=3764_3137+3230 | TCTGCCAAAGGAGATTTGCCC | 2 | |
| 7 | prec9554 | igr2959#chr2#x1=14390339#l=3764_3137+3230 | CTGCCAAAGGAGATTTGCCC | 5 |
Gene Sequence:
gugggauacu gagauacugu ugguauauuc ucuucuucuc caccgaauau aucuuugucu 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 uugcccuuuc ccccuuccuu cgaugugaua ccuaaucaac cacucucaac accauccaac 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... 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cuauuucucc uucucuagag gaauaggcga gaaauugaga uuaauaaaaa 360 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 gggguguuuu uugguucucc uucguuugua uaaagccugc cgcuucuuaa gguucuuugg 420 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... 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uuuggcaaaa guaacaauua agcagcagca gcagaaguga 660 .......*** ********** *******... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 ........** ********** *********. .......... .......... .......... prec5827 ........** ********** ********.. .......... .......... .......... prec5831 .........* ********** *********. .......... .......... .......... prec9530 ........** ********** *********. .......... .......... .......... prec9542 ........** ********** ********.. .......... .......... .......... prec9554 aguuucuccc guuagguggc uuugauacaa gucuuggagc uuucgaauuu cuuugagguu 720 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... 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GACGGGCACA GAACAUUUUC 1260 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 UCAAACCUUG AAGAAACCAU UGGCAAAAUC GAUGAGUUCC UGUCGUUCGA GAGGGGAUUU 1320 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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UCACCCUUGA UGAUGGGACC 1560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 AACUAUGAGG UCCUUGUAGA UGGUCAAGAU AAACUUGUGG CCAUUCCCCC AAAUUUACUC 1620 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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AUGCUCAUGA UUUUUGGCCC 2160 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 GAACAGUUUG UUGUGGAAAA GGAAACCUGC AACAGCAAAA AAUGGGGAGU UGUGAAGGCU 2220 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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ACCUACUUAC AGAGAGUGAC 2460 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 UACAGUGGCG CAUAUUUUUU GUCAAGUAUU GGUGUUGUUA CAGGUUUUAA AAAUGGUUCC 2520 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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UUCCGGAAUG UAGUUCAUUU 2760 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 UUCCUUCCAA AAGCUGCCAU UGGAUUUAUC ACAAACCUUG CAUCAAGCCU UUUUGGUUAU 2820 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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AAGUGAGAUU CAGACAGUUU 3060 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 GAUAUGGUUA AUGACUGCUC GGACCAUCAU UUCCUUUCUU CGGAUAAAGG GUUGGCUCAG 3120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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AUCAUUCAGG UGGGAUGCGA 3360 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 CUGAAUCCGA ACCUGUAUGA GUCAGGAAGA GUUUGCUUGA GUCUGCUGAA UACAUGGAGU 3420 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 GGCGUCCCUG UAGGAUCAUC AGCUAACCUG CAGGGGAACU CAACCACAAA UUCCACCGGU 3780 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 UUCAAGAUCA UGCUCUCCAA ACUCUACCCA AAACUUCUUG AAGCAUUCUC AGAGAUUGGA 3840 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... 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uugcgagguc gguagucucc 3960 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9542 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9554 uccccaugua gaauauguuu uguaauucaa ugcgugagaa uaaaaccgcu guaaaauagg 4020 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec16355 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5821 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5831 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec9530 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