At2g28350.1 68409.m03117 auxin response transcription factor
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec11497 | igr3768#chr5#x1=18615936#l=2646_1332-1412 | TGCCTGGCTCCCTGTATGCCAC | 2 | ath-MIR160c |
| 2 | prec11519 | igr3768#chr5#x1=18615936#l=2646_1330-1414 | TATGCCTGGCTCCCTGTATGCC | 3 | ath-MIR160c |
| 3 | prec2062 | igr1679#chr4#x1=8848676#l=7609_5316+5400 | CGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCAC | 2 | ath-MIR160b |
| 4 | prec2086 | igr1679#chr4#x1=8848676#l=7609_5318+5398 | TGCCTGGCTCCCTGTATGCC | 3 | ath-MIR160b |
| 5 | prec2098 | igr1679#chr4#x1=8848676#l=7609_5318+5398 | TGCCTGGCTCCCTGTATGCCAC | 2 | ath-MIR160b |
Gene Sequence:
AUGGAGCAAG AGAAAAGCUU GGAUCCACAA CUAUGGCAUG CUUGUGCAGG AUCAAUGGUU 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 CAAAUCCCUU CACUGAAUUC AACGGUUUUU UACUUCGCUC AAGGCCACAC AGAGCACGCU 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 CACGCGCCUC CUGAUUUUCA CGCGCCGCGC GUUCCACCUC UUAUCCUCUG UCGUGUCGUC 180 .......... .......... .......... 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CCUCCGUGAC 720 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 GACGAGUCAA CAACAACAAC AUCGAAGCUA AUGAUGAUGA AACGCAACGG AAACAACGAC 780 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 GGAAACGCCG CGGCUACAGG GAGGGUUAGA GUAGAAGCAG UAGCGGAAGC GGUGGCGCGU 840 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... 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AGGAUUCCGC AGCCAUUUGA GUUUCCAUUC CACGGUACUA AAUUCCCGAU UUUCUCCCCG 1260 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 GGAUUCGCCA ACAAUGGCGG UGGCGAGUCC AUGUGUUAUC UGUCAAACGA CAACAAUAAU 1320 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 GCUCCUGCAG GAAUACAGGG AGCCAGGCAA GCUCAACAAC UCUUCGGAUC ACCAUCUCCG 1380 .......*** ********** *********. 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GUGUUAUCAA ACGUAUUGGA 1920 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 GACGAACCUU UCAGUGAUUU CAUGAAAGCA ACUAAACGGC UAACAAUCAA GAUGGAUAUU 1980 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 GGUGGCGACA ACGUGAGAAA GACGUGGAUA ACCGGAAUCA GGACUGGUGA AAAUGGUAUA 2040 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 GACGCUUCUA CGAAGACUGG UCCGCUCAGC AUCUUCGCUU GAacuugaag cauauugagg 2100 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2062 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2086 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2098 aauaagcagu ggccuuuguu uugaaccuaa uuuuauuucu gucuuuaauu cucuuuuuuc 2160 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11497 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec11519 .......... .......... 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