At1g52150.2

At1g52150.2 68408.m08709 HD-Zip transcription factor

Matching miRNAs:
miRNA nameIGR namemature miRNA sequenceTargetsRfam
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5prec16219igr4997#chr3#x1=22923315#l=10188_6888+6997TCGGACCAGGCTTCATTCCC2ath-MIR166b

Gene Sequence:

acaucucuuc uucauccucu cuucuacuuu ccucuuuccu cuuuccuucu ucgaauaaau     60 
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uucuaggguu uuucuuuucu cuaaaguuuu cauuuuuauu ucaaugagag cucgaagaag    120 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10608
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec16219

gagaauaugg guuugagaac ugauaauauu auggcuucgu uucgaggugg aaucgggguu    180 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10608
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ucuaauggcu gagucaacuc ggugauucug uguuauaguc acgagcaaau auaaaaaagu    240 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
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uuguaacuuu cuuguuuuuu uaggugugug uguucagaga aaaggucgaa ucuuuuuucg    300 
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guguuuguaa aagggaaagu uguaaucuua aagucuguuu uucuuucuug uguuuuggua    360 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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uuuagcucau aaaagccgag gaguaauaua aaggauaggu uuugucuuug ugugcccuuu    420 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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ugagauugca ugaagaaaaa aagccucuag uguguuuuga aggaaacaga auucgauauu    480 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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uaugcgguaa ugugauuugu gaagcuacuc caagugcuua ggauuugaga uggcuuagau    540 
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uugguaguug uucaagcugu ggaguuugug guggacuaag aagcucucug ucuccuuugu    600 
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uuaguauguu gugguuaucu ucuguuuaga aggauuuagu uauucaucug gaggggguag    660 
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uagggucauu ugugagauuc ugugauugug aaauaagaag aguuuugcug aggaguaAUG    720 
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GCAAUGUCUU GCAAGGAUGG UAAGUUGGGA UGUUUGGAUA AUGGGAAGUA UGUGAGGUAU    780 
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ACACCUGAAC AAGUUGAAGC ACUUGAGAGG CUUUAUCAUG ACUGUCCUAA ACCGAGUUCU    840 
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AUUCGCCGUC AGCAGUUGAU CAGAGAGUGU CCUAUUCUCU CUAACAUUGA GCCUAAACAG    900 
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AUCAAAGUGU GGUUUCAGAA CCGAAGAUGU AGAGAGAAAC AAAGGAAAGA GGCUUCACGG    960 
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CUUCAAGCUG UGAAUCGGAA GUUGACGGCA AUGAACAAGC UCUUGAUGGA GGAGAAUGAC   1020 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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AGGUUGCAGA AGCAAGUGUC ACAGCUGGUC CAUGAAAACA GCUACUUCCG UCAACAUACU   1080 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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CCAAAUCCUU CACUCCCAGC UAAAGACACA AGCUGUGAAU CGGUGGUGAC GAGUGGUCAG   1140 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
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CACCAAUUGG CAUCUCAAAA UCCUCAGAGA GAUGCUAGUC CUGCAGGACU UUUGUCCAUU   1200 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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GCAGAAGAAA CUUUAGCAGA GUUUCUUUCA AAGGCAACUG GAACCGCUGU UGAGUGGGUU   1260 
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CAGAUGCCUG GAAUGAAGCC UGGUCCGGAU UCCAUUGGAA UCAUCGCUAU UUCUCAUGGU   1320 
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........** ********** ********.. .......... .......... ..........        prec10576
....****** ********** ********.. .......... .......... ..........        prec10608
........** ********** ********.. .......... .......... ..........        prec14492
........** ********** ********.. .......... .......... ..........        prec16219

UGCACUGGUG UGGCAGCACG CGCCUGUGGC CUAGUGGGUC UUGAGCCUAC AAGGGUUGCA   1380 
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GAGAUUGUCA AGGAUCGUCC UUCGUGGUUC CGCGAAUGUC GAGCUGUUGA AGUUAUGAAC   1440 
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GUGUUGCCAA CUGCCAAUGG UGGAACCGUU GAGCUGCUUU AUAUGCAGCU CUAUGCACCA   1500 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
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ACUACAUUGG CCCCACCACG CGAUUUCUGG CUGUUACGUU ACACCUCUGU UUUAGAAGAU   1560 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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GGCAGCCUUG UGGUGUGCGA GAGAUCUCUU AAGAGCACUC AAAAUGGUCC UAGUAUGCCA   1620 
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CUGGUUCAGA AUUUUGUGAG AGCAGAGAUG CUUUCCAGUG GGUACUUGAU ACGGCCUUGU   1680 
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GAUGGUGGUG GCUCAAUCAU ACACAUAGUG GAUCAUAUGG AUUUGGAGGC UUGUAGCGUG   1740 
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CCUGAGGUCU UGCGCCCGCU CUAUGAGUCA CCCAAAGUAC UUGCACAGAA GACAACAAUG   1800 
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GCGGCACUGC GUCAGCUCAA GCAAAUAGCU CAGGAGGUUA CUCAGACUAA UAGUAGUGUU   1860 
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AAUGGGUGGG GACGGCGUCC UGCUGCCUUA AGAGCUCUCA GCCAGAGGCU AAGCAGAGGC   1920 
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UUCAAUGAAG CUGUAAAUGG UUUCACUGAU GAAGGAUGGU CAGUGAUAGG AGAUAGCAUG   1980 
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GAUGAUGUCA CAAUCACUGU AAACUCUUCU CCAGACAAGC UAAUGGGUCU AAAUCUUACA   2040 
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UUUGCCAAUG GCUUUGCUCC UGUAAGCAAU GUUGUUUUAU GCGCAAAAGC AUCAAUGCUU   2100 
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UUACAGAAUG UUCCUCCGGC GAUCCUGCUU CGGUUUCUGA GGGAGCAUAG GUCAGAAUGG   2160 
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GCUGACAACA ACAUUGAUGC GUAUCUAGCA GCAGCAGUUA AAGUAGGGCC UUGUAGUGCC   2220 
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CGAGUUGGAG GAUUUGGAGG GCAGGUUAUA CUUCCACUUG CUCAUACUAU UGAGCAUGAA   2280 
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GAGUUUAUGG AAGUCAUCAA AUUGGAAGGU CUUGGUCAUU CCCCUGAAGA UGCAAUCGUU   2340 
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CCAAGAGAUA UCUUCCUUCU UCAACUUUGU AGCGGAAUGG AUGAAAAUGC UGUAGGAACC   2400 
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UGUGCGGAAC UUAUAUUUGC UCCAAUCGAU GCUUCGUUUG CGGAUGAUGC ACCUCUGCUU   2460 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
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CCUUCUGGUU UUCGUAUUAU CCCUCUUGAU UCCGCAAAGC AGGAAGUAUC UAGCCCAAAC   2520 
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CGAACCUUGG AUCUUGCUUC GGCACUGGAA AUUGGUUCAG CUGGAACAAA AGCCUCAACU   2580 
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GAUCAAUCAG GAAACUCCAC AUGUGCAAGA UCUGUGAUGA CAAUAGCAUU UGAGUUUGGU   2640 
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AUCGAGAGCC AUAUGCAAGA ACAUGUAGCA UCCAUGGCUA GGCAGUAUGU UCGAGGUAUC   2700 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
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AUAUCAUCGG UGCAGAGAGU AGCAUUGGCU CUUUCUCCUU CUCAUAUCAG CUCACAAGUU   2760 
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GGUCUACGCA CUCCUUUGGG UACUCCUGAA GCCCAAACAC UUGCUCGUUG GAUUUGCCAG   2820 
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AGUUACAGGG GCUACAUGGG UGUUGAGCUA CUUAAAUCAA ACAGUGACGG CAAUGAAUCU   2880 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10576
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AUUCUUAAGA AUCUUUGGCA UCACACUGAU GCUAUAAUCU GCUGCUCAAU GAAGGCCUUG   2940 
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CCCGUCUUCA CAUUUGCAAA CCAGGCGGGA CUUGACAUGC UGGAGACUAC AUUAGUUGCU   3000 
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CUUCAAGACA UCUCUUUAGA GAAGAUAUUU GAUGACAAUG GAAGAAAGAC UCUUUGCUCU   3060 
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GAGUUCCCAC AGAUCAUGCA ACAGGGCUUC GCGUGCCUUC AAGGCGGGAU AUGUCUCUCA   3120 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec10096
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AGCAUGGGGA GACCAGUUUC GUAUGAGAGA GCAGUUGCUU GGAAAGUACU CAAUGAAGAA   3180 
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GAAAAUGCUC AUUGCAUCUG CUUUGUGUUC AUCAAUUGGU CCUUUGUGUG Agauuuauug   3240 
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uauuuuguau uuucagacua agcuuuugcc uuuuggcugu auuguaaaac ggucauguug   3300 
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uuguuguugu uguuguuguu cuugauguug cugugaacac guaaaacagu guuuuguuuc   3360 
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aaaacucaag aaaugcuugc uuaauuugua guuugauuaa gagugauaau gaugaucuuu   3420 
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uucuuuucuu guu  3433 
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