Functional Clusters Overview

Functional Clusters Experiments

Exp id Data type Data filter Min genes cluster Max genes cluster Max cluster size E-value Tandems removal
1 MapMan No filter applied. 2 30 80 0.001
2 MapMan No filter applied. 2 30 80 0.001
3 GO All GO data. 2 30 80 0.001
4 GO All GO data. 2 30 80 0.001
5 InterPro No filter applied. 2 30 80 0.001
6 InterPro No filter applied. 2 30 80 0.001

Species and Available Functional Cluster Experiments

Organisms MapMan Experiments GO Experiments InterPro Experiments
Acer truncatum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Actinidia chinensis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Aethionema arabicum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Amaranthus hybridus 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Amborella trichopoda 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Anthoceros agrestis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Aquilegia oxysepala 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Arabidopsis lyrata 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Arabidopsis thaliana 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Arachis hypogaea 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Avicennia marina 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Beta vulgaris 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Brassica carinata 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Brassica napus 1 3 , 4 5 , 6
Brassica oleracea 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Brassica rapa 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Camellia sinensis var. sinensis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Cannabis sativa 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Capsella rubella 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Capsicum annuum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Cardamine hirsuta 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Carica papaya 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Carpinus fangiana 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Carya illinoinensis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Ceratophyllum demersum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Chara braunii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Chenopodium quinoa 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Chlamydomonas reinhardtii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Cicer arietinum L. 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Citrullus lanatus 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Citrus clementina 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Coffea canephora 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Corchorus olitorius 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Corylus avellana 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Cucumis melo 1 , 2 3 , 4 6
Cucumis sativus L. 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Daucus carota 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Davidia involucrata 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Durio zibethinus 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Erigeron canadensis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Erythranthe guttata 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Eucalyptus grandis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Eutrema salsugineum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Fragaria vesca 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Fragaria x ananassa 1 , 2 3 , 4 6
Glycine max 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Gossypium hirsutum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Gossypium raimondii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Helianthus annuus 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Hydrangea macrophylla 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Lactuca sativa 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Lonicera japonica 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Lotus japonicus 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Lupinus albus 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Magnolia biondii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Malus domestica 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Manihot esculenta 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Marchantia polymorpha 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Medicago truncatula 1 3 , 4 5 , 6
Micromonas commoda 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Nelumbo nucifera 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Nicotiana tabacum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Olea europaea 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Oryza sativa ssp. japonica 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Papaver somniferum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Petunia axillaris 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Phaseolus vulgaris 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Physcomitrium patens 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Pisum sativum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Populus trichocarpa 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Prasinoderma coloniale 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Prunus persica 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Punica granatum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Quercus lobata 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Rhododendron simsii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Rosa chinensis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Salix brachista 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Salvia bowleyana 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Sapria himalayana 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Schrenkiella parvula 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Sechium edule 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Selaginella moellendorffii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Selenicereus undatus 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Sequoiadendron giganteum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Simmondsia chinensis 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Solanum lycopersicum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Solanum pennellii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Solanum tuberosum 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Striga asiatica 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Tarenaya hassleriana 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Theobroma cacao 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Trifolium pratense 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Tripterygium wilfordii 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Trochodendron aralioides 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Utricularia gibba 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Vaccinium macrocarpon 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Vanilla planifolia 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Vigna mungo 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Vitis vinifera 1 , 2 3 , 4 5 , 6
Zea mays 1 , 2 3 , 4 5 , 6