At1g29240.1

At1g29240.1 68408.m03236 expressed protein

Matching miRNAs:
miRNA nameIGR namemature miRNA sequenceTargetsRfam
1prec1402igr140#chr1#x1=582220#l=2039_509+594CTTCATCTTCATCATCATCAG76
2prec1406igr140#chr1#x1=582220#l=2039_509+583CTTCATCTTCATCATCATCAG76
3prec1410igr140#chr1#x1=582220#l=2039_509+589CTTCATCTTCATCATCATCAG76
4prec1414igr140#chr1#x1=582220#l=2039_509+586CTTCATCTTCATCATCATCAG76

Gene Sequence:

cuacuuucag cuuaccuuuu ucuucuccaa gucccaucuu cgucuccguc aucuucacgg     60 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

cacauccucc aaaaacgcuu agcuucucuc ucuguuacgu uuacucaagu cuuuuuuagu    120 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

cuccuccuua acucucaagc cuuuuccaag uuucaagcgg cuccaacggu ucaauuucgc    180 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

acuuuccgau uuguggcuuc acuuuccgau cuguucuaga gaacuucaau auauauccau    240 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

auaugguuuc auuggucugu gagccauauc cuaagaacua aacuagcuag cucucuuacu    300 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

AUGGAGGAGA GGAAACUGAA CUUCAGCGUA CCUCUUCUUU CAACAAGACG GAUGCAGAAG    360 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

ACAGCAGGAG UCUCUGUGCG UAGAAACAAG AGUAAUAACU UCACUGAUUA UGACUCUAAG    420 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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ACAAGUGAAU GUCCUUCUGU UCCAGUUCUU GUUCCAUAUA UGAUGGGUUU AGAUGAUGAG    480 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
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GUUACUGAAC CUGCCUCUGU UCCUUUCACU UGGGAACAAG CUCCUGGAAG AUUAAAGGGC    540 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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AAUGAUUUCA AACCCCAAGU UUGUGUUUUG AUGAAAGAAG AAGAACAAGU UUUUACACCA    600 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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UGUCUUCCAC CGGGUAAAGC CGUUGAUGCA AACAUGACAA GAUUGCAGAG UUCAAAGGGU    660 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

AAACAAGUUG AAGAAUCAGA UGAUGAUGAA GAUGAUGUGU UUUCUGAUGC UCUUGACACU    720 
.......... ......**** ********** *******... .......... ..........        prec1402
.......... ......**** ********** *******... .......... ..........        prec1406
.......... ......**** ********** *******... .......... ..........        prec1410
.......... ......**** ********** *******... .......... ..........        prec1414

CUCUCUCCAA AGGACUCGUU UUCUUUUAAC AAUAGCAUUA GUGGUGUGAG UGAAUAUGGU    780 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

GGCGUUGAGA CCAAGAAACC ACUGGAUGCU CAAUCUCGGG AUUUCAUGAU GAGUCGUUUU    840 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

UUACCAGCUG CCAAAGCUAU GACUGUGGAG CAGUCUCAUU AUGCUUCGAA UCGAAAACCA    900 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

UCCACUUUUA UGGCUGAACC AACGAUACAG AUAAGAGAGU UAGUACCGGG GGAGAAGCAG    960 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

CAAACUCCUA AUAGAUAUGA UGUGUCUAUA GUCCCAUCUU ACUAUUACCA CCAAGACAUU   1020 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

GAUGAUGAAG AAAGCAAGGU GGGUGAGGAA GAUGAUGAAG UUUCUGAGUA CGCCUAUCUU   1080 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

UCAAAGAGAG GUUGUGGAAU GUUGCCACAA UUGUGCUUUA AAGACUCUCU CGGCAUGCUG   1140 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

AACACAGUGC CUGGUUUUAA AGCUAAACAC AACUCUCCAA UAACAUCACC AAGUCAUGAU   1200 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

CAAGUGAAGU CAAGCAAGGU UGCUCAACUC AAAUAUCGAU UCCAAUCUGU UAAAAAGCUA   1260 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

GCUCUUGAUU CAGUUUCUAA GCACAAGUUG AGUGGUAAAG UUCAUUCACC AGUUCAUCCA   1320 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

AGCAAUGGGA AGAAGUUCAA CUCUGAAUCA AACUUGAUUU CUGCUGCGAA GAGGUCUUCA   1380 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

UCUCCUUACA GACACUCUCG CUGUAUGUCA CCAUUUCGCA GUACAGGUAA CGGUUCUCCU   1440 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

UUACACCAUG CGGGUUUCCC UGAGACUCGU AGGGAAACCG AGAACCUGAG AGCUAACAGG   1500 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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UUGAGCAAUC AUACUAGAAA CAUAAGCAGG ACGUCUCAGG AGUUACUCUA CCCAAAAAGC   1560 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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AAUGGUUCAA UCUUGGAGAA GACAGUUUAU GUCGACACCG AGAAUGAUCA CAUGACCAAU   1620 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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GAUCAGCAUA ACUCAAAUCU CAUGAUCUUU CCAGAGGAAG CAGAUAUGAC AGGAAGGAAA   1680 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

CCAGAUGCCA AUCCUGAACU UGAAGCUUUU GAAAAUAUAA GUAUUAGAAG UAGUGAAAUG   1740 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1414

GUGAAGGGAA AUGAGUUAGU AGAGAUCAGU AGUGGUUUUG AUCGGUCUCC UCUUGCACCA   1800 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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CCUUCUCCCA AAAGGCCUUC UGAAUCUUGG CUUUGUCAUA AUCUGCCUUC AGUAACUUCU   1860 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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CAGAUCACUU CACGUAGAUA UCAUCCAUUC AACCCCCAAA AGCAGGAUCU UACAGAAAAC   1920 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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UACAGAAAUG GUACCAAGUG GGAAACUAUU GUUAAGACUU CCUACAUGCA CAGAGAUCAU   1980 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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AUCCGAUAUU CCGAAGAACU GGUUGCUCAU ACAUCUCAUC AAUCCAAAAC UUGAgaccuu   2040 
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.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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gaugcuucuc gaguucugac cuccccgaga ucaucagguu uauaccuacg uuucagcuca   2100 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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aucauuaguu auuugguagu cauuucaucc acuggugaaa agaaaauaug ugcuuguuuu   2160 
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1402
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1406
.......... .......... .......... .......... .......... ..........        prec1410
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augaaccuca uuuacaugug cagcuucaau auuaacucua auuaaugagg caaauacu  2218 
.......... .......... .......... .......... .......... ........       prec1402
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