Class | Gene name | Locus name | Function | Gene name | Locus name | Function | |||||||||||||
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SQUA | AP1/AGL7 | At1g69120 | floral meristem identity | [1] | OSMADS14 | AF058697 | interacts with MADS6 | [24] | |||||||||||
CAL/AGL10 | At1g26310 | floral meristem identity | [2] | OsMADS15 | AF058698 | interacts with MADS6 | [24] | ||||||||||||
FUL/AGL8 | At5g60910 | floral meristem-fruit valve identity | [3] | OsMADS28 | AJ011675 | interacts with MADS6 | [24] | ||||||||||||
At3g30270 | OsMADS20 | AY250075 | |||||||||||||||||
DEF | AP3 | At3g54340 | floral organ identity | [4] | SPW1 | AF424549 | B, interacts with MADS4 | [25,26] | |||||||||||
GLO | PI | At5g20240 | floral organ identity | [5] | OsMADS2 | L37526 | [27] | ||||||||||||
OsMADS4 | L37527 | [28] | |||||||||||||||||
AG | AG | At4g18960 | floral organ identity | [6] | OsMADS3 | L37528 | control stamen and carpel identity | [29] | |||||||||||
SHP1 | At3g58780 | control fruit dehiscence zone | [7] | OsMADS13 | AF151693 | ovule | [30] | ||||||||||||
SHP2 | At2g42830 | control fruit dehiscence zone | [7] | OsMADS21 | AY177693 | ||||||||||||||
AGL11/STK | At4g09960 | ovules | [8] | ||||||||||||||||
AGL2 | SEP1/AGL2 | At5g15800 | class E | [9] | OsM79 | Y15008 | flower | ||||||||||||
SEP2/AGL4 | At3g02310 | class E | [9] | OsMADS1 | L34271 | lemma, palea | [31] | ||||||||||||
SEP3/AGL9 | At1g24260 | class E | [9] | OsMADS34 | AB003324 | ||||||||||||||
AGL3 | At2g03710 | all above ground organs | [10] | OsMADS5 | U78890 | flowering | [32] | ||||||||||||
OsMADS7 | U78891 | flowering | [33] | ||||||||||||||||
OSMADS8 | U78892 | flowering | [33] | ||||||||||||||||
OsMADS37 | AY177701 | ||||||||||||||||||
3577.m00124 | |||||||||||||||||||
TM3 | SOC1 | At2g45660 | flowering promotor | [11] | |||||||||||||||
AGL14 | At4g11880 | roots | [8] | ||||||||||||||||
AGL19 | At4g22950 | roots | [12] | ||||||||||||||||
AGL42 | At5g62165 | ||||||||||||||||||
At5g51860 | |||||||||||||||||||
At5g51870 | |||||||||||||||||||
TM8 | 2418.m00089 | ||||||||||||||||||
GGM13 | ABS/TT16 | At5g23260 | seed coat | [13,14] | OsMADS29 | AY177697 | |||||||||||||
OsMADS30 | AY174093 | ||||||||||||||||||
OsMADS31 | AY177698 | fruit | |||||||||||||||||
STMADS11 | AGL24 | At4g24540 | flowering promotor (vernalization) | [15] | OsMADS47 | AJ293816 | |||||||||||||
SVP | At2g22540 | flowering repressor | [16] | 3772.m00147 | |||||||||||||||
2525.m00099 | |||||||||||||||||||
AGL12 | AGL12 | At1g71692 | root, developing embryos | [8] | OsMADS32 | AY177699 | |||||||||||||
OsMADS33 | AY177700 | pistil | |||||||||||||||||
AGL15 | AGL15 | At5g13790 | [17] | ||||||||||||||||
AGL18 | At3g57390 | [12] | |||||||||||||||||
AGL17 | AGL16 | At3g57230 | root, leaf epidermis | [12] | OsMADS23 | AY177694 | |||||||||||||
AGL17 | At2g22630 | lateral root cap | [8] | OsMADS25 | AY177695 | ||||||||||||||
AGL21 | At4g37940 | root, developing embryos | [18] | OsMADS27 | AY177696 | ||||||||||||||
ANR1 | At2g14220 | nitrate inducible lateral root formation | [19] | OsMADS57 | AY224482 | [35] | |||||||||||||
5593.m00172 | |||||||||||||||||||
AGL6 | AGL6 | At2g45650 | flowers | [20] | OsMADS17 | AF109153 | interacts with MADS6 | [24] | |||||||||||
AGL13 | At3g61120 | ovules | [8] | ||||||||||||||||
OsMADS6 | U78782 | lodicules | [24] | ||||||||||||||||
FLC | FLC | At5g10140 | flowering repressor (vernalization) | [21] | |||||||||||||||
FCL1/MAF5 | At5g65080 | flowering promotor (vernalization) | [22] | ||||||||||||||||
FCL2/MAF4 | At5g65070 | flowering repressor (vernalization) | [22] | ||||||||||||||||
MAF1 | At1g77080 | flowering repressor (vernalization) | [22] | ||||||||||||||||
MAF2 | At5g65050 | flowering repressor (vernalization) | [23] | ||||||||||||||||
MAF3 | At5g65060 | flowering repressor (vernalization) | [23] | ||||||||||||||||
![]() |
![]() |
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SQUA | ZAP1 | L46400 | AP1 ortholog/male and female | [36] | FBP26 | AF176783 | vegetative to reproductive | [45] | |||||||||||
ZMM15 | AJ430632 | [37] | FBP29 | AF335245 | [46] | ||||||||||||||
ZMM4 | AJ430641 | [37] | PFG | AF176782 | floral meristem identity | [45] | |||||||||||||
ZmMADS3 | AF112150 | fertilisation, early embryogenesis, | [38] | ||||||||||||||||
ZMM28 | AJ430695 | ||||||||||||||||||
DEF | SILKY1 | AF181479 | floral organ identity | [37] | PMADS1/GP | X69946 | interacts with FBP1 | ||||||||||||
ZMM16 | AJ292959 | floral organ identity | [39] | PhTM6 | AF230704 | [47,48] | |||||||||||||
GLO | ZMM18 | AJ292960 | floral organ identity | [40] | PMADS2 | X69947 | [46] | ||||||||||||
ZMM29 | AJ292961 | [40] | FBP1 | M91190 | petals and stamen identity | [48] | |||||||||||||
AG | ZAG1 | L18924 | early in stamen and carpel primordia | [40] | PMADS3 | X72912 | floral meristem, C function | [49] | |||||||||||
ZAG2 | L18925 | restricted to developing carpels. | [41] | FBP6 | X68675 | carpels | [50] | ||||||||||||
ZMM1 | AJ430630 | [41] | FBP7 | X81651 | ovule identity | [51] | |||||||||||||
ZMM2 | AJ430631 | [37] | FBP11 | X81852 | ovule identity | [52] | |||||||||||||
ZMM23 | AJ430637 | [37] | [53] | ||||||||||||||||
AGL2 | ZMM14 | AJ005338 | upper florets | [37] | FBP2 | M91666 | |||||||||||||
ZMM24 | AJ430638 | [42] | FBP4 | AF335234 | [51] | ||||||||||||||
ZMM25 | AJ430639 | [37] | FBP5 | AF335235 | interacts with FBP11 | [46] | |||||||||||||
ZMM27 | AJ430694 | [37] | FBP9 | AF335236 | interacts with FBP11 | [54] | |||||||||||||
ZMM3 | Y09301 | [37] | FBP23 | AF335241 | [55] | ||||||||||||||
ZMM6 | AJ430692 | [43] | [46] | ||||||||||||||||
ZMM7 | Y09302 | [37] | |||||||||||||||||
ZMM8 | Y09303 | upper florets | [43] | ||||||||||||||||
ZMM31 | AJ430640 | [42] | |||||||||||||||||
TM3 | ZMM5 | AJ430642 | [37] | FBP20 | AF335238 | ||||||||||||||
ZmMADS1 | AF112148 | fertilisation, early embryogenesis, | [37] | FBP21 | AF335239 | ||||||||||||||
[38] | FBP22 | AF335240 | [46] | ||||||||||||||||
FBP28 | AF335244 | [46] | |||||||||||||||||
GGM13 | ZMM17 | AJ271208 | B sister ovule and carpel wall | FBP24 | AF335242 | [46] | |||||||||||||
STMADS11 | ZMM26 | AJ430693 | [13] | FBP13 | AF335237 | ||||||||||||||
ZMM19 | AJ430633 | [37] | FBP25 | AF335243 | [46] | ||||||||||||||
ZMM20 | AJ430634 | [37] | [46] | ||||||||||||||||
ZMM21 | AJ430635 | [37] | |||||||||||||||||
AGL17 | ZmMADS2 | AF112149 | pollen tubes upon germination | [37] | |||||||||||||||
AGL6 | ZAG3 | L46397 | [44] | PMADS4 | AB031035 | sepals, petals, carpels | |||||||||||||
ZAG5 | L46398 | [36] | [56] | ||||||||||||||||
[36] | |||||||||||||||||||