At3g57920.1 68410.m05967 squamosa promoter-binding protein homolog
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec18827 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 7 | ath-MIR156d |
| 2 | prec18857 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156d |
| 3 | prec18871 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2545 | TTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 11 | ath-MIR156d |
| 4 | prec18881 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2546 | GTTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 12 | ath-MIR156d |
| 5 | prec19162 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 6 | prec19178 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3581 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 7 | prec19210 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 7 | ath-MIR156e |
| 8 | prec3205 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4188+4281 | GGTGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 10 | ath-MIR156f |
| 9 | prec3217 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156f |
| 10 | prec3249 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 7 | ath-MIR156f |
| 11 | prec3773 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3561-3644 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 10 | ath-MIR156a |
| 12 | prec3817 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3562-3643 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156a |
| 13 | prec8264 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_56+137 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 14 | prec8284 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_57+136 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 15 | prec8512 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3138-3222 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 10 | ath-MIR156c |
| 16 | prec8580 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3139-3221 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156c |
Gene Sequence:
acauuuucuu uccucuauuc uccuccgucc uuacuauuuc cagaguucag uacuuagaaa 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19210 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3249 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... 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UCUGAGUUUG ACUUGGAGAA AAGAAGUUGU 480 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18827 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18871 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19210 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3205 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3249 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... 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