At2g33810.1 68409.m03749 squamosa-promoter binding protein -related
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec18857 | igr795#chr5#x1=3454190#l=5083_2459-2544 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156d |
| 2 | prec19162 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3586 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 3 | prec19178 | igr886#chr5#x1=3863724#l=4928_3491+3581 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156e |
| 4 | prec3217 | igr2044#chr5#x1=9109684#l=5223_4190+4279 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156f |
| 5 | prec3773 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3561-3644 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 10 | ath-MIR156a |
| 6 | prec3817 | igr2102#chr2#x1=10621377#l=6616_3562-3643 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156a |
| 7 | prec8264 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_56+137 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 8 | prec8284 | igr2848#chr4#x1=14039889#l=4299_57+136 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACA | 13 | ath-MIR156b |
| 9 | prec8512 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3138-3222 | CTGACAGAAGAGAGTGAGCACACA | 10 | ath-MIR156c |
| 10 | prec8580 | igr2928#chr4#x1=14377290#l=6844_3139-3221 | TGACAGAAGAGAGTGAGCACAC | 13 | ath-MIR156c |
Gene Sequence:
caaccacaaa auaaaccggg guggugucau agcaucgaca uuaacuuaaa acuacaaaau 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 agagcugggu ccucgucagg uuuuaaggau acauauguau gcauguaugc auauacaaaa 120 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... 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AGAGGAAGAA GAAGAAGAAA 420 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19178 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3217 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3773 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3817 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8264 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8284 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8512 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec8580 CUGAAGAUGA AGAUACUUUU GAAGAAGAAG AGGCUUUGGA GAAGAAGCAG AAAGGUAAAG 480 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec18857 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec19162 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