At1g54150.1 68408.m05663 zinc finger (C3HC4-type RING finger) protein family
Matching miRNAs:
| miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | prec1102 | igr1201#chr3#x1=4804107#l=2637_1618+1718 | CCGGCAAGTCATCCTTGGCT | 1 | |
| 2 | prec1869 | igr1621#chr1#x1=6694921#l=2247_535+637 | AGGCAAGTCATCCTTGGCTACC | 1 | |
| 3 | prec2901 | igr1929#chr5#x1=8503345#l=5327_1911-2017 | CCGGCAAGTCATCCTTGGCTGCAT | 1 | |
| 4 | prec2911 | igr1929#chr5#x1=8503345#l=5327_1912-2016 | CGGCAAGTCATCCTTGGCTGCA | 1 | |
| 5 | prec3110 | igr2011#chr4#x1=10447721#l=2403_320+398 | CCGGCAAGTCATCCTTGGCT | 1 | |
| 6 | prec5308 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1235+1364 | AGGCAAGTCATCCTTGGCTACC | 1 | |
| 7 | prec5352 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1594+1740 | CAGGCAAGTCATCCTTGGCTAC | 1 | |
| 8 | prec5388 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1594+1740 | AGGCAAGTCATCCTTGGCTAC | 1 | |
| 9 | prec5460 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_4804+4933 | AGGCAAGTCATCCTTGGCTACC | 1 | |
| 10 | prec5540 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_5150+5296 | AGGCAAGTCATCCTTGGCTA | 1 | |
| 11 | prec5608 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7445+7576 | AGGCAAGTCATCCTTGGCTACC | 1 | |
| 12 | prec5652 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7800+7947 | CAGGCAAGTCATCCTTGGCTAC | 1 | |
| 13 | prec5688 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7800+7947 | AGGCAAGTCATCCTTGGCTAC | 1 | |
| 14 | prec9821 | igr3097#chr5#x1=15478185#l=2723_661+874 | CGGCAAGTCATCCTTGGCTG | 1 |
Gene Sequence:
uuguccgugu gaccgugucu acgacguuga aaucgaaauu accacaAUGU CCUCGCCGGA 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1102 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1869 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2911 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec3110 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5308 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5352 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5388 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5460 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5540 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5608 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5652 .......... .......... 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