At1g17590.1 68408.m01959 transcription factor -related
Matching miRNAs:
miRNA name | IGR name | mature miRNA sequence | Targets | Rfam | |
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1 | prec1853 | igr1621#chr1#x1=6694921#l=2247_533-638 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTG | 2 | |
2 | prec1875 | igr1621#chr1#x1=6694921#l=2247_533-637 | GGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 3 | |
3 | prec1881 | igr1621#chr1#x1=6694921#l=2247_533-638 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 2 | |
4 | prec2908 | igr1929#chr5#x1=8503345#l=5327_1912+2016 | TGCAGCCAAGGATGACTTGCCG | 2 | |
5 | prec5292 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1235-1365 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTG | 2 | |
6 | prec5314 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1235-1364 | GGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 3 | |
7 | prec5324 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1235-1365 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 2 | |
8 | prec5370 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1593-1740 | GTAGCCAAGGATGACTTGCCTG | 3 | |
9 | prec5396 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_1593-1740 | GTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 3 | |
10 | prec5444 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_4804-4934 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTG | 2 | |
11 | prec5466 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_4804-4933 | GGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 3 | |
12 | prec5476 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_4804-4934 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 2 | |
13 | prec5548 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_5150-5296 | TAGCCAAGGATGACTTGCCT | 3 | |
14 | prec5566 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7447-7574 | TAGCCAAGGATGACTTGCCTGT | 4 | |
15 | prec5592 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7445-7577 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGT | 2 | |
16 | prec5614 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7445-7576 | GGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 3 | |
17 | prec5624 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7445-7577 | TGGTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 2 | |
18 | prec5670 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7799-7947 | GTAGCCAAGGATGACTTGCCTG | 3 | |
19 | prec5696 | igr2356#chr3#x1=9872012#l=10062_7799-7947 | GTAGCCAAGGATGACTTGCCT | 3 | |
20 | prec9825 | igr3097#chr5#x1=15478185#l=2723_662-874 | CAGCCAAGGATGACTTGCCG | 2 |
Gene Sequence:
aucaaaagaa uacacacaca cacauacaca cuguugagua ucuaucugag agaauaagca 60 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1853 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1875 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2908 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5292 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5314 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5324 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5370 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5396 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5444 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5466 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5476 .......... .......... 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UGAgccggug 1200 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1853 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1875 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec1881 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec2908 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5292 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5314 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5324 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5370 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5396 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5444 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5466 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5476 .......... .......... .......... .......... .......... .......... prec5548 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